袁崇煥帶兵火急火燎趕到北京城下時已是半夜，因京師戒嚴，左安門守軍不敢開城門，便叫袁部在城外等著，直到更時才有兵部差官前來詢問。袁崇煥把皇太極潛越薊州，自己追趕不及，不得已到京師勤王等情節簡要書就，讓差官帶回，滿心希望皇帝能體諒自己的一片丹心，卻不知此時朝堂之上的明爭暗斗已到了白熱化的程度。

斗爭的根源還是閹黨。年輕的皇帝朱由檢雖說對閹黨深惡痛絕，但也知道不能一桿子把一船人都打翻了。閹黨禍害天下非一日兩日，氣焰囂張時如日中天，就連自命清高的東林黨人中也有不少迫于形勢委身求全的。既然無法一網打盡，便總有些漏網之魚。隨著周延儒、溫體仁等人重新被起用，閹黨余孽又活躍起來。溫體仁首先拿錢謙益入閣一事做文章，揭發錢謙益在天啟二年主試浙江時，收受童生田千秋賄賂，以一句“一朝平步上青天”為關節，將田千秋定為省試第一。本來這件事是舊案，錢謙益也早因此受過責罰，這會兒重新翻出來，無非是借題發揮，利用新登基皇帝朱由檢的心結打擊東林黨。果然，錢謙益罷免，替錢謙益說話的首輔錢龍錫和吏科給事中章允儒問罪下獄。閹黨余孽首戰告捷引起了東林黨的警覺，御史毛九華、任贊化揭發溫體仁賄賂閹黨首逆、為魏忠賢作詩、仗勢欺人等罪狀，給事中祖重曄、左都御史曹于汴聯名彈劾溫體仁，都被溫體仁借口黨爭避了過去。唯獨袁崇煥在遼東威望甚高，為皇帝所倚重，一日不除便難撼動東林黨根本，于是便有了前番曹永祚彈劾袁崇煥通敵引虜，袁弘勛翻擅殺毛文龍舊賬等情節，但皇帝只是起了疑心，并沒有拿袁崇煥怎么樣。如今后金大軍兵臨城下，閹黨余孽馬上意識到這又是一個千載難逢的良機，南京吏部尚書王永光書信溫體仁，提醒到正可借此事翻案。等兵部將袁崇煥大軍來到京師勤王的消息稟告皇帝的時候，朝議上新晉右僉都御史梁廷棟首先發難，只聽他道：“自古勤王之師遇敵都是節節抵抗，哪有縱敵深入到京師才勤王的？袁崇煥縱非故意放敵，也必有失職之處。”

皇帝朱由檢方寵信梁廷棟，聽了連連點頭。

御史高捷火上澆油道：“臣聞毛文龍在東江時后金從不敢深入，如今毛文龍一死，后金大軍便入關，可見坊間傳聞袁崇煥與皇太極殺文龍謀和款確有其事。”

成基命見勢不妙趕緊爭辯道：“坊間傳聞，皇上切不可輕信。前日監軍方大任疏報‘薊兵不可用，惟遼兵可用，宜當速召京師入衛’。臣度袁崇煥必是擔心京師有失，故而火速來援，請陛下明察。”

御史史褷見皇帝又有些動搖，奏道：“臣聞袁崇煥擅殺毛文龍一事，錢龍錫是主謀，則通款一事龍錫也脫不了干系。”

皇帝朱由檢本就痛恨錢龍錫包庇錢謙益一事，聽到殿上重又提起錢龍錫的名字，氣不打一處來，立命錦衣衛去拿錢龍錫，讓他上廷奏辯。

禮部尚書東閣大學士李標實在看不下去，斥道：“后金兵臨城下，京營久不被兵，勝負難測。袁崇煥入衛正可保京師萬全，如何要借他故生事，自毀干城。陛下英明，輕重緩急自有分寸，何須汝等混淆視聽。”

他這一當頭棒喝，皇帝朱由檢總算清醒了過來，問道：“袁崇煥現在城下，如何處之？”

又是周延儒出來奏道：“廷上所議都有道理。為皇上計，請先派人去查明遼兵情況，若其果為入衛，則厚賜安撫，若其別有用心，再另作處置。”

朱由檢欣然道：“還是愛卿考慮周到。命馮允生等到城下勞軍，查明情況，速來回報。”